Micropigmentarea presupune un disconfort redus, gestionat prin creme anestezice aplicate înainte și în timpul procedurii. Senzația variază în funcție de zonă și de sensibilitatea fiecărei persoane.
Zona buzelor și a pleoapelor poate fi mai sensibilă decât sprâncenele, dar anestezicul topic reduce semnificativ disconfortul. Sensibilitatea poate fi mai mare în perioada menstruală. După procedură pot apărea ușoare umflături și roșeață, care se retrag în câteva zile.